JH004-线粒体检测试剂盒

在人体细胞中,线粒体扮演着极为关键的角色,一旦其发生碱基突变、缺失等异常情况,将会引发一系列错综复杂且影响深远的后果。

线粒体作为细胞的能量工厂,负责通过氧化磷酸化过程产生大量的三磷酸腺苷(ATP),为细胞的各种生命活动提供能量动力。当线粒体出现碱基突变时,可能会直接影响到线粒体基因组所编码的蛋白质或 RNA 的结构与功能。例如,某些与电子传递链相关的蛋白质若因碱基突变而发生结构改变,就可能导致电子传递效率降低,进而使氧化磷酸化过程受阻,细胞无法获得充足的能量供应。这会在宏观上表现为人体整体的疲劳感加剧、肌肉无力,因为肌肉细胞对能量的需求极为旺盛,能量供应不足时其收缩功能便会受到明显抑制。

线粒体碱基缺失同样不容小觑。缺失可能会造成线粒体基因的移码突变,使得后续的基因编码信息全部错乱,导致一系列蛋白质无法正确合成。在神经系统方面,可能引发神经退行性疾病,如帕金森病、阿尔茨海默病等的发生风险显著增加。因为神经细胞高度依赖线粒体供能,且对线粒体功能异常极为敏感,线粒体功能障碍会导致神经细胞的代谢紊乱、轴突运输受损以及神经递质合成与释放异常等。

在心脏组织中,线粒体的异常也会产生严重危害。心肌细胞持续有节律地收缩需要稳定而充足的能量支持,线粒体碱基突变或缺失引发的能量危机,会导致心肌收缩力减弱、心律失常等心脏疾病症状,长期积累甚至可能发展为心肌病、心力衰竭等危及生命的状况。

此外,线粒体的这些异常还可能对细胞的信号传导通路产生干扰。正常情况下,线粒体参与细胞内多种信号通路的调节,如细胞凋亡信号通路。当线粒体功能受损时,可能会错误地激活或抑制某些凋亡相关信号分子,打破细胞增殖与死亡的平衡,一方面可能导致细胞过度增殖而增加肿瘤发生的风险,另一方面也可能使细胞过早凋亡,影响组织器官的正常结构与功能完整性,例如在免疫系统中,免疫细胞功能可能因线粒体异常而受到抑制,削弱机体的免疫防御能力,使人体更容易受到病原体的侵袭。

我们使用MLPA-NGS技术开发的线粒体检测试剂盒,在CNV检测方面包含线粒体上42个位点,常染色体20个位点,X染色体4个位点,Y染色体4个位点。CNV探针可判断线粒体上是否发生缺失或重复等大片段的CNV变异。在人体中,线粒体的拷贝数远远高于基因组的拷贝数,因此本试剂盒不适合对常染色体及X、Y染色体的拷贝数进行分析,但可分析线粒体与基因组的拷贝数比值。在SNV检测方面,则涵盖线粒体基因组17个位点。对每个位点的检测精度大部分可达到1%以下,少部分存在临近位点干扰者,精度为2-3%以下。另外,该试剂盒还包含16个SNP位点,12个拟SNP位点,作为SNP位点的质量控制。由于人基因组拷贝数远低于线粒体基因组,所得reads数往往远低于质控的要求,本试剂盒对于基因组SNP的检测,仅有参考作用。检测详细情况参见 线粒体检测试剂盒说明书

在您使用该试剂盒前,请阅读 MLPA-NGS技术原理与通用实验流程。在实验流程中,通过模板解链、探针与模板杂交、使用连接酶将杂交到模板上相邻探针的连接后,需使用带有不同index的引物扩增连接探针,以便以不同index区分样本。我们提供了8条正向(Forward)引物(森林绿色,ForestGreen)和12条反向(Reverse)引物(红色,Red),可产生96种组合,从而实现一次最多混样上机测序96个样本的性能。在 实验测序样本标签及测序单模板文件中,输入引物编号,可显示index序列,用于填写测序单。

SNP亲子鉴定检测试剂盒包含的检测位点,见 线粒体检测试剂盒位点信息,该文件包含了每个位点的核心序列或SNP,核心序列或SNP在染色体上的位置,每个位点进行reads分析时所用左、中、右标签的序列,绘图时柱体与柱头的颜色,以及一些其他注释等。

为方便用户分析,我们为用户提供了一批 线粒体样本fastQ文件。fastQ文件是根据实际测试样本,使用软件模拟生成的,非实际人源样本,但具有实际样本的全部性质。用户可下载该批文件,使用MLPA-NGS Analyzer软件的“fastQ analysis”模块进行分析。软件下载和软件使用手册见本网站“软件下载”部分。分析时,用户把fastQ文件放入某个文件夹,使用MLPA-NGS Analyzer软件打开该文件夹,点击“检索”导入全部fastQ文件,全选或选择部分文件后点击“运行”,即可获得每个位点的reads等信息,并最后生成两个文件,一为机读工程文件,后缀为mln,另一为人读工程文件,即Excel文件。两个文件内容一致,都包含每个样本的reads,SNP分型等信息。为方便用户,本网站已将分析该批样本所得 线粒体机读工程文件线粒体人读工程文件放置下方,用户可直接下载。使用MLPA-NGS Analyzer 软件的 “CNV analysis” 模块,可打开线粒体机读工程文件,对线粒体测序数据进行CNV绘图、阅读和分析。

下载列表:
线粒体检测试剂盒说明书
MLPA-NGS技术原理与通用实验流程
实验测序样本标签及测序单模板
线粒体检测试剂盒位点信息
线粒体样本fastQ文件
线粒体机读工程文件
线粒体人读工程文件