Y 染色体微缺失是指男性 Y 染色体上的部分基因片段丢失的现象。Y
染色体是男性特有的染色体,它在男性的性别决定和生殖功能等诸多方面发挥关键作用。当 Y 染色体出现微缺失时,会对男性的生育能力等产生影响。
涉及的区域和相关基因:
Y 染色体上有多个与精子发生相关的区域,比较重要的是
AZF(无精子因子)区域,它分为 AZFa、AZFb 和 AZFc 三个主要区域:
AZFa
区域缺失:会导致严重的生精障碍,大部分患者表现为唯支持细胞综合征,也就是睾丸内几乎只有支持细胞,而没有精子生成的细胞。
AZFb
区域缺失:常导致精子发生阻滞,主要是在精母细胞阶段,使得精子无法正常产生。
AZFc
区域缺失:这是临床上最常见的缺失类型,情况相对复杂。部分患者可能仍有少量精子生成,但精子数量和质量通常也会受到明显影响,不过也有一些患者表现为严重的少精症或无精症。
我们使用MLPA-NGS技术开发的Y染色体微缺失检测试剂盒,包含Y染色体109个位点,涵盖SRY区域,AZFa、AZFb
和
AZFc区域,不但可以检测相关区域的缺失,而且当发生Y染色体部分或全部区域嵌合型缺失或其他类型的拷贝数变异时,也能检测。除Y染色体外,该试剂盒还涵盖X染色体31个位点,常染色体44个位点(每条染色体2个位点),X染色体和常染色体信息可作为对照。另外,该试剂盒还包含16个SNP位点,用于标记样本,12个拟SNP位点,作为SNP位点的质量控制。详细情况参见
Y染色体微缺失试剂盒说明书。
Y染色体微缺失检测试剂盒是基于MLPA-NGS
技术开发的检测试剂盒。在您使用该试剂盒前,请阅读
MLPA-NGS技术原理与通用实验流程 。
在实验流程中,通过模板解链、探针与模板杂交、使用连接酶将杂交到模板上相邻探针连接后,需使用带有不同index的引物扩增连接探针,以便以不同index区分样本。我们分别提供了8条正向(Forward)引物(森林绿色,ForestGreen)和12条反向(Reverse)引物(红色,Red),可产生96种组合,从而实现一次最多混样上机测序96个样本的性能。在
实验测序样本标签及测序单模板文件中,输入引物编号,可显示index序列,用于填写测序单。
Y染色体微缺失试剂盒包含的检测位点,见
Y染色体微缺失检测试剂盒位点信息,该文件包含了每个位点的核心序列或SNP,核心序列或SNP在染色体上的位置,每个位点进行reads分析时所用左、中、右标签的序列,绘图时柱体与柱头的颜色,以及一些其他注释等。
为方便用户分析,我们为用户提供了一批Y染色体微缺失样本的fastQ文件
。fastQ文件是根据实际测试样本,使用软件模拟生成的,非实际人源样本,但具有实际样本的全部性质。用户可下载该批文件,使用MLPA-NGS
Analyzer软件的“fastQ analysis”模块进行分析。软件下载和软件使用方法见本网站“软件下载”部分。分析时,用户把fastQ文件放入某个文件夹,使用MLPA-NGS
Analyzer软件打开该文件夹,检索导入全部fastQ文件,全选或选择部分文件后点击“运行”,即可获得每个位点的reads等信息,并最后生成两个文件,一为机读工程文件,后缀为mln,另一为人读工程文件,即Excel文件。两个文件内容一致,都包含每个样本的reads,SNP分型等信息。依文件大小,每个文件的分析需要10分钟上下,为方便用户,本网站已将分析该批样本所得
Y染色体微缺失机读工程文件
和Y染色体微缺失人读工程文件 放置下方,用户可直接下载。使用MLPA-NGS
Analyzer 软件的 “CNV analysis” 模块,可打开Y染色体微缺失机读工程文件 ,用户可进行对照选择、阅读和分析样本 CNV等操作。
下载列表:
Y染色体微缺失试剂盒说明书
MLPA-NGS技术原理与通用实验流程
实验测序样本标签及测序单模板
Y染色体微缺失检测试剂盒位点信息
Y染色体微缺失样本的fastQ文件
Y染色体微缺失机读工程文件
Y染色体微缺失人读工程文件